Мир, возможно, был восстановлен в Хоэнне после того, как злые планы Команды Аква, Команды Магмы и более позднего Убежища Хитрости были прекращены. Однако, когда надвигался новый кризис, Стиву Стоуну ничего не оставалось, кроме как снова заручиться помощью Рубина, Сапфира и Изумруда. Что заставило молодых тренеров приобщиться к таинственным силам Mega Evolution? Был ли кризис каким-либо образом связан со странными символами «омега» и «альфа» на невиданной ранее фреске, изображающей Граудона и Кьогре в Гранитной пещере? Джозеф Стоун, отец Стивена и президент Devon Corporation, мог быть в курсе чего-то важного, когда заметил неприметный знак «дельта» на картине ...
